Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms