Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPN20Q4JDL3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPN20Q4JDL3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN20Q4JDL3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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