Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM187BQ17R55 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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