Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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