Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms