Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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