Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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