Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CCDC85BQ15834 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CCDC85BQ15834 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CCDC85BQ15834 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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