Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ALX1Q15699 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALX1Q15699 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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