Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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COL9A3Q14050 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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COL9A3Q14050 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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