Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms