Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ATP1A4Q13733 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ATP1A4Q13733 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ATP1A4Q13733 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ATP1A4Q13733 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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