Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TUBB3Q13509 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TUBB3Q13509 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TUBB3Q13509 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TUBB3Q13509 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TUBB3Q13509 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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