Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LSAMPQ13449 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LSAMPQ13449 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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