Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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