Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC173Q0VFZ6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms