Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms