Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms