Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms