Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms