Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H3F3AP84243 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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