Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOMO3P69849 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms