Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms