Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIF1P55008 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AIF1P55008 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms