Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms