Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC3P51654 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC3P51654 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPC3P51654 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC3P51654 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPC3P51654 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPC3P51654 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPC3P51654 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPC3P51654 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC3P51654 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC3P51654 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC3P51654 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC3P51654 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC3P51654 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms