Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPFP49454 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPFP49454 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPFP49454 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPFP49454 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPFP49454 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPFP49454 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPFP49454 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPFP49454 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPFP49454 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPFP49454 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPFP49454 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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