Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX1P48742 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms