Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD8P48556 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms