Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms