Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM5CP41229 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms