Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-FP30511 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms