Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD10P28358 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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