Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms