Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms