Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP4AP20648 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms