Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms