Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 NFRKB-205ENST00000526940 539 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB1P14653 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB1P14653 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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