Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms