Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFLP07196 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFLP07196 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms