Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZBED1O96006 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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