Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms