Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CYTIPO60759 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.8 ms