Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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