Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms