Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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