Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HHLA1C9JL84 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms