Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms