Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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