Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms